《秘傳》卷一和《中藏經》的卷上、卷中，基本相同。《中藏經》多一篇五臟六腑辨證的緒言；第四十六篇論三痞，多了3個藥方。
臟腑辨證即論五臟六腑虛實寒熱生死逆順脈證之法(秘傳肝臟作生死逆從，其他皆作逆順)。二書對五臟六腑的序列不同。
《秘傳》為肝、心、脾、肺、腎、膽、小腸、胃、大腸、膀胱、三焦。五臟在前，六腑在後，按五行木火土金水生克關係而排列，臟腑表裡關係的順序也對，和《外台》相同。
《中藏經》的排列順序為肝、膽、心、小腸、脾、胃、肺、大腸、腎、膀胱、三焦。一臟一腑，表裡配合，五行生克相同，和《千金》一樣。
由此可見此二書的寫作時間，均在唐以前，六朝時代，華陀弟子，述華陀遺意，並履經後人修改，有此兩種版本傳留。
-- 摘自《華陀神醫秘傳》彭靜山點校 遼寧科學技術出版社 p.323
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